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Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  25 lines
  1. ***************************************************
  2. * Aspartic acid and asparagine hydroxylation site *
  3. ***************************************************
  4.  
  5. Post-translational  hydroxylation of aspartic acid or  asparagine [1] to  form
  6. erythro-beta-hydroxyaspartic acid  or erythro-beta-hydroxyasparagine  has been
  7. identified in a number of proteins with domains homologous to epidermal growth
  8. factor (EGF).   Examples  of such  proteins  are the blood coagulation protein
  9. factors VII, IX and X, proteins C, S, and Z, the LDL receptor, thrombomodulin,
  10. etc.  Based on sequence comparisons  of the EGF-homology region  that contains
  11. hydroxylated Asp or Asn, a consensus sequence  has been identified  that seems
  12. to be required by the hydroxylase(s).
  13.  
  14. -Consensus pattern: C-x-[DN]-x(4)-[FY]-x-C-x-C
  15.                     [D or N is the hydroxylation site]
  16.  
  17. -Note: this  consensus  pattern  is  located  in  the  N-terminal  of EGF-like
  18.  domains, while  our  EGF-like    cysteine pattern signature (see the relevant
  19.  section) is located in the C-terminal.
  20.  
  21. -Last update: January 1989 / First entry.
  22.  
  23. [ 1] Stenflo J., Ohlin A.-K., Owens W.G., Schneider W.J.
  24.      J. Biol. Chem. 263:21-24(1988).
  25.